Die Eisen-Ruinen sind ein antikes Überbleibsel aus einer längst vergangenen Zeit, deren Eingang auf der Eiseninsel, nahe ihres Höhlenausgangs, liegt.
Im normalen Spielverlauf hat dieser Ort keinerlei Bedeutung, trägt man jedoch das Event-Regigigas im Team, so beginnen die Muster am Boden, die spezifisch dem Regi angepasst sind, zu leuchten. Läuft man nun über dieses Muster komplett drüber, hat sich irgendetwas in der Luft verändert und es ist möglich, gegen die Statue in der Mitte des Raums zu kämpfen, wobei in diesem Fall ein Registeel erscheint.
Die Eisen-Ruinen sieht man in den Episode Chaos auf der Eiseninsel! und Auf den letzten Drücker!. Sie stellen im Anime allerdings nicht den Fundort von Registeel, sondern einen Tempel für Dialga und Palkia dar. Team Galaktik versucht dort die Speersäule zu finden, indem sie unter anderem ihre Maschinen, den Speerschlüssel und die Energie, die die Ruine ausstrahlt miteinander kombinieren. Nachdem ihre Maschinen zerstört wurden, wird bekannt, dass sie Bomben in den Ruinen platziert hätten, um die Eiseninsel zu zerstören. Hordeo und sein Lucario können die Explosion jedoch ableiten, sodass der Plan misslingt.